IFRD2 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-421054

Panoramica

Il regolatore dello sviluppo correlato all’interferone 2 (IFRD2) è un coregolatore trascrizionale implicato nel controllo di programmi di espressione genica che modellano la differenziazione cellulare e le risposte adattative allo stress. Nei sistemi murini, IFRD2 è studiato per i suoi potenziali ruoli nella modulazione di complessi trascrizionali associati alla cromatina e nel coordinamento di output di segnalazione dipendenti dal contesto che influenzano la proliferazione e l’impegno di linea. Un’alterata regolazione delle proteine della famiglia IFRD è stata collegata a processi di sviluppo compromessi e a segnalazioni infiammatorie o di risposta allo stress aberranti, rendendo Ifrd2 un locus utile per studi meccanicistici nell’omeostasi tissutale. Il targeting di Ifrd2 può aiutare a chiarire come le dinamiche di repressione/attivazione trascrizionale si interfaccino con le vie a valle che governano il destino cellulare e il rimodellamento.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO IFRD2 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Ifrd2 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Ifrd2 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Ifrd2 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina IFRD2.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Ifrd2 per lo studio della segnalazione di IFRD2, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Ifrd2 critici per la funzione di IFRD2
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Ifrd2 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal IFRD2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal IFRD2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Ifrd2. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal IFRD2 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR IFRD2 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Ifrd2 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Ifrd2 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.