HCF1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-403097

Panoramica

HCFC1 codifica per il fattore della cellula ospite 1 (HCF1), un co-regolatore trascrizionale associato alla cromatina che fa da ponte tra fattori di trascrizione specifici di sequenza e complessi di modifica degli istoni, coordinando programmi di espressione genica necessari per la progressione del ciclo cellulare e per l’identità cellulare. HCF1 partecipa al controllo epigenetico di promotori ed enhancer, supportando vie correlate alla transizione G1/S, alla competenza per la replicazione del DNA e all’omeostasi trascrizionale. L’alterazione della funzione di HCFC1 è stata implicata in fenotipi di neurosviluppo e nella disabilità intellettiva legata al cromosoma X; reti trascrizionali dipendenti da HCF1 alterate sono inoltre studiate nel contesto della proliferazione oncogenica. In quanto nodo centrale per il rimodellamento della cromatina e l’assemblaggio dei fattori di trascrizione, HCF1 è frequentemente analizzato in studi sulla regolazione dei promotori, sul controllo del ciclo cellulare e sui circuiti di espressione genica a livello genomico.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO HCF1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene HCFC1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del HCFC1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto HCFC1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina HCF1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di HCFC1 per lo studio della segnalazione di HCF1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni HCFC1 critici per la funzione di HCF1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di HCFC1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal HCF1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal HCF1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus HCFC1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal HCF1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR HCF1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia HCFC1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio HCFC1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.