Non dati CRISPR: l'immagine illustra la qualità degli anticorpi per la visualizzazione dei risultati degli esperimenti CRISPR.
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GSDMDC1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (r): sc-437380
- Specie Target: rat
- 20 µg di DNA plasmidico purificato, pronto per trasfezione; sufficiente fino a 20 trasfezioni
- GSDMDC1 Il plasmide CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (r) è un pool di plasmidi, ciascuno dei quali codifica la nucleasi Cas9 e un RNA guida (gRNA) specifico per il bersaglio di 20 nt, progettato per la massima efficienza di knockout utilizzando sequenze derivate dalla libreria GeCKO v2
- Le sequenze gRNA indirizzano Cas9 a indurre rotture a doppio filamento (DSB) sito-specifiche nel locus genomico GSDMDC1, con conseguente knockout genico tramite giunzione non omologa (NHEJ)
- I geni di resistenza alla puromicina e RFP sono fiancheggiati da siti LoxP, consentendo la rimozione dei marcatori di selezione tramite la ricombinasi Cre (Cre Vector: sc-418923) dopo aver stabilito linee cellulari knockout stabili
- In seguito alla trasfezione, l'efficienza dll'attivazione genica può essere testata con WB, IF o IHC utilizzando l'anticorpo: GSDMDC1 Antibody (H-11): sc-393581
Informazioni ordini
| Nome del prodotto | Codice del prodotto | UNITÀ | Prezzo | Quantità | Preferiti | |
GSDMDC1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (r) | sc-437380 | 20 µg | $397.00 |
Panoramica
Il GSDMDC1 del ratto codifica una proteina contenente un dominio gasdermin, associata al rimodellamento di membrana e a programmi regolati di morte cellulare, processi che contribuiscono a modellare la segnalazione dell’immunità innata e l’omeostasi tissutale. I membri della famiglia delle gasdermine si collocano comunemente a valle di cascate di proteasi infiammatorie e possono influenzare la formazione di pori, i flussi ionici e il rilascio di mediatori infiammatori, intersecandosi così con vie come la segnalazione dell’inflammasoma e la citotossicità indotta da stress. Sebbene GSDMDC1 sia meno caratterizzato rispetto alle gasdermine canoniche, la sua architettura di domini suggerisce ruoli nell’integrità epiteliale e nelle risposte al danno. La disregolazione delle vie associate alle gasdermine è stata collegata a fenotipi infiammatori e degenerativi, rendendo GSDMDC1 un bersaglio utile per studi meccanicistici in modelli di ratto rilevanti per la malattia.
Il plasmide CRISPR/Cas9 KO GSDMDC1 (r) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene in linee cellulari rat. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.
Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina GSDMDC1.
Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di per lo studio della segnalazione di GSDMDC1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.
Caratteristiche principali
- sgRNA mirati agli esoni critici per la funzione di GSDMDC1
Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di per migliorare l'efficienza del knockout
Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione
Varianti di progettazione
CRISPR +/- HDR
- Gli gRNA codificati dal GSDMDC1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (r) e dal GSDMDC1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (r2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus . Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
I costrutti donatori HDR codificati dal GSDMDC1 Plasmide HDR (r) e il plasmide HDR GSDMDC1 (r2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.