GDPD3 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-405288

Übersicht

GDPD3 (Glycerophosphodiester-Phosphodiesterase-Domäne enthaltend 3) ist eine humane Glycerophosphodiesterase, die am Abbau von Phospholipiden und am Remodeling von Glycerophospholipiden beteiligt ist – Prozesse, die die Membranzusammensetzung und lipidvermittelte Signalwege prägen. Durch die Hydrolyse von Glycerophosphodiestern kann GDPD3 die zellulären Metabolitenpools beeinflussen, die Membrantransport, Organell-Homöostase und umfassendere Netzwerke des Lipidstoffwechsels unterstützen. Eine veränderte Regulation des Glycerophospholipidstoffwechsels ist häufig mit Änderungen in Proliferation, Stressanpassung und immunbezogener Signalübertragung verknüpft, wodurch GDPD3 ein relevanter Knotenpunkt für mechanistische Studien zur metabolischen Reprogrammierung ist. Veränderungen in Expression und Aktivität von Lipidenzymen, einschließlich GDPD3, wurden in unterschiedlichen krankheitsrelevanten Kontexten beschrieben und stützen die Untersuchung seines Beitrags zu einer gestörten Lipid-Homöostase.

Das GDPD3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des GDPD3-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des GDPD3-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von GDPD3 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die GDPD3-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von GDPD3-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der GDPD3-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf GDPD3-Exone abzielen, die für die GDPD3-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere GDPD3-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom GDPD3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom GDPD3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des GDPD3-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das GDPD3 HDR-Plasmid (h) und GDPD3 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von GDPD3-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten GDPD3-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.