FSD1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-406328

Übersicht

FSD1 (fibronectin type III and SPRY domain containing 1) kodiert ein zytosolisches Protein, das SPRY- und fibronectin‑Typ‑III‑ähnliche Domänen enthält, was auf eine Rolle bei Protein‑Protein‑Interaktionen und der Regulation von Signalkomplexen hindeutet. Berichtetete funktionelle Zusammenhänge verorten FSD1 in der Kontrolle der Zytoskelettorganisation und mikrotubuli‑assoziierter Prozesse, mit potenziellen Auswirkungen auf Zellarchitektur, intrazellulären Transport und Stressantworten. Expression und genomische Veränderungen von FSD1 wurden in Krebsdatensätzen beobachtet, was seine Nutzung als Kandidatengen zur Untersuchung von Mechanismen unterstützt, die Proliferation, Migration und zelluläre Fitness beeinflussen. Als bislang relativ wenig charakterisierter Faktor ist FSD1 zudem für Studien zur Entdeckung von Signalwegen relevant, die domänenvermittelte Scaffold‑Proteine mit nachgeschalteten Signalausgängen verknüpfen.

Das FSD1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des FSD1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des FSD1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von FSD1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die FSD1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von FSD1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der FSD1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf FSD1-Exone abzielen, die für die FSD1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere FSD1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom FSD1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom FSD1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des FSD1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das FSD1 HDR-Plasmid (h) und FSD1 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von FSD1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten FSD1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.