C21orf62 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406451

Panoramica

C21orf62 (chromosome 21 open reading frame 62) codifica una proteina umana ancora poco caratterizzata, con collegamenti emergenti alla biologia cellulare fondamentale, inclusa la regolazione di processi nucleari e di reti geniche associate al ciclo cellulare. I dataset genomici e trascrittomici disponibili suggeriscono un’espressione dipendente dal contesto e un possibile coinvolgimento in vie che coordinano eventi associati alla cromatina e risposte allo stress cellulare, sebbene i dettagli meccanicistici restino limitati. Le variazioni nella regione genomica 21q sono state esplorate in studi su fenotipi neuroevolutivi e proliferativi, rendendo C21orf62 rilevante per indagare gli effetti del dosaggio genico e le perturbazioni di pathway. L’analisi loss-of-function può aiutare a definire il suo contributo a programmi trascrizionali, alla fitness cellulare e alla modulazione del fenotipo in sistemi modello rilevanti per la malattia.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO C21orf62 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene C21orf62 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del C21orf62 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto C21orf62 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina C21orf62.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di C21orf62 per lo studio della segnalazione di C21orf62, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni C21orf62 critici per la funzione di C21orf62
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di C21orf62 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal C21orf62 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal C21orf62 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus C21orf62. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal C21orf62 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR C21orf62 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia C21orf62 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio C21orf62 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.