ZNF91の化学的活性化剤は、タンパク質のリン酸化状態を調節することにより、多様な細胞内シグナル伝達経路を介してその活性を調節することができる。フォルボール12-ミリスチン酸13-酢酸はそのような活性化剤の一つであり、プロテインキナーゼC(PKC)を活性化する役割で知られている。PKCは多くの細胞内シグナル伝達カスケードにおいて極めて重要な役割を果たしており、ZNF91を直接リン酸化してその活性を変化させることができる。もう一つの活性化因子であるフォルスコリンは、細胞内のcAMPを増加させることで作用し、その結果プロテインキナーゼA(PKA)が活性化される。PKAは次にZNF91をリン酸化し、DNA結合親和性を変化させ、その機能を調節する可能性がある。イオノマイシンは、細胞内カルシウムレベルを上昇させることにより機能し、ZNF91をリン酸化することができるカルシウム依存性プロテインキナーゼを活性化する。タプシガルギンは、小胞体/小胞体Ca2+ ATPase(SERCA)を阻害することによって間接的に作用し、細胞質カルシウム濃度の上昇をもたらし、その後ZNF91をリン酸化の標的とするキナーゼを活性化する。
さらに、カリクリンAとオカダ酸は、細胞内のタンパク質の脱リン酸化を担う酵素であるプロテインホスファターゼ1および2Aを阻害する。これらの阻害は、ZNF91を含むタンパク質の持続的なリン酸化をもたらし、ZNF91を活性化状態に維持する。アニソマイシンはストレス活性化プロテインキナーゼ(SAPK)を活性化する。SAPKは遺伝子発現に関与する制御タンパク質をリン酸化することが知られており、これにはZNF91も含まれる。StaurosporineとBisindolylmaleimide Iは、典型的なキナーゼ阻害剤であるが、特定の条件下ではPKCを活性化し、ZNF91のリン酸化につながる。cAMPの合成アナログであるジブチリル-cAMPはPKAを活性化し、ZNF91をリン酸化の標的とする。PKA阻害剤であるH-89は、逆説的に、代償的な細胞メカニズムによってPKAを活性化し、ZNF91を活性化させる。最後に、エピガロカテキンガレート(EGCG)はキナーゼシグナル伝達経路を調節することができ、阻害剤としての役割はよく知られているが、ZNF91をリン酸化するキナーゼを活性化する可能性がある。
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