SLC38A9阻害剤は、このタンパク質の正常な機能、特にアミノ酸の感知と輸送に不可欠な様々なシグナル伝達経路を阻害することによって作用する。これらの経路の中で重要なのは、SLC38A9がアルギニンセンサーとして働くmTORC1経路である。特異的mTOR阻害剤のようなmTOR経路を標的とする阻害剤は、mTORC1の活性化を妨げることにより、この感知能力を破壊する。この阻害は、下流のシグナル伝達だけでなく、上流のセンサーにも影響を及ぼし、アミノ酸レベルに対するSLC38A9の機能的応答を低下させる。さらに、mTORC1の上流制御因子であるPI3Kに作用する阻害剤は、SLC38A9がその役割を発揮するために重要なmTORC1シグナル伝達経路を減衰させることにより、間接的にSLC38A9の活性低下をもたらす。これらの阻害剤は相乗的に働き、SLC38A9の機能を制御するシグナルを減衰させることにより、SLC38A9のアミノ酸感知・輸送能力を低下させる。
さらに、PI3K/mTOR二重阻害剤は、PI3K経路とmTOR経路の両方を標的とすることで、SLC38A9の機能をさらに損ない、複雑さをさらに増している。このような包括的阻害は、SLC38A9が属するシグナル伝達ネットワークの重要なノードに影響を及ぼし、タンパク質のアミノ酸感知・輸送活性をさらに顕著に低下させる。同じ経路内の複数のポイントを攻撃することにより、これらの阻害剤は、基質に対するSLC38A9の応答を効果的に低下させ、アミノ酸の利用可能性に応答する細胞能力を低下させる。これらの阻害剤の影響はSLC38A9にとどまらず、mTOR経路によって支配されている、より広範な細胞成長、増殖、代謝の制御機構を阻害するためである。
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