OR5D13は様々な方法で受容体と相互作用し、シグナル伝達経路を開始する。一価不飽和脂肪酸であるオレイン酸はリガンドとして機能し、受容体に結合し、OR5D13を活性化する構造変化を引き起こす。同様に、モノテルペノイドの一種であるシトロネラールとフェニルプロペンの一種であるオイゲノールは、どちらもOR5D13のリガンド結合ドメインに結合し、受容体を活性化させる。一般にバナナオイルとして知られる酢酸イソアミルも、リガンド結合ドメインに結合することでOR5D13を活性化し、芳香族アルデヒドであるベンズアルデヒドは、アーモンドの香りの検出に関連するGタンパク質共役反応を開始するリガンドとして機能する。モノテルペノイドであるゲラニオールとメントールは、リガンド結合によってOR5D13を活性化し、受容体に変化を起こすことで、関連するGタンパク質が活性化され、嗅覚シグナル伝達が開始される。
芳香族化合物であるアネトールは、リガンド結合部位に結合することでOR5D13を活性化し、構造変化を引き起こす。シンナムアルデヒドも同様の方法でOR5D13と相互作用し、受容体を活性化し、Gタンパク質シグナル伝達経路を介した細胞内事象のカスケードを引き起こす。テルペンアルコールであるリナロールと、サリチル酸のエステルであるサリチル酸メチルも、リガンドと受容体の結合を介してOR5D13を活性化し、嗅覚経路を介したシグナル伝達を引き起こす。最後に、アルデヒドの一種であるヘキサナールは、OR5D13に結合して活性化し、コンフォメーション変化を誘発してGタンパク質シグナル伝達経路の活性化を開始し、独特の香りの知覚に寄与する。これらの化学物質はそれぞれ特異的にOR5D13と相互作用し、受容体を活性化させ、独特の嗅覚シグナルを伝達する。
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