例えば、OR3A3阻害剤WortmanninとLY294002は、細胞増殖、生存、代謝を制御する経路を含む多くのシグナル伝達経路において極めて重要な構成要素であるPI3Kを阻害する。PI3Kの阻害は、これらの経路に変化をもたらし、その結果、経路によって制御されているタンパク質の活性に影響を与える。PKC阻害剤であるBisindolylmaleimide IとホスホリパーゼC阻害剤であるU73122は、細胞の分化や細胞外シグナルへの応答などのプロセスに重要なシグナル伝達カスケードを調節することができる。
PD98059とSP600125のような阻害剤は、それぞれMAPK/ERKとJNKシグナル伝達経路を標的とする。両シグナル伝達経路は、ストレスや成長シグナルに対する細胞の反応に不可欠であり、したがってこれらの反応に関与するタンパク質の機能に影響を及ぼす可能性がある。SB203580によるp38 MAPキナーゼの阻害は、炎症性サイトカインやストレスに対する細胞の反応に影響を与え、間接的にタンパク質の活性に影響を与える可能性がある。ゲニステインとNF449は、それぞれチロシンキナーゼとGPCRシグナル伝達を阻害する。この経路は、細胞生理の多くの側面を制御することが知られており、それによって様々なタンパク質の機能を調節する可能性がある。LFM-A13とGo6983は、それぞれB細胞受容体シグナル伝達と複数のPKC依存性経路を阻害し、これらの経路に関与するタンパク質の活性を変化させる可能性がある。最後に、PP2はSrcファミリーキナーゼの阻害剤として、多数のタンパク質を制御する特定のシグナル伝達経路を破壊する可能性がある。
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