L'orthovanadate de sodium joue un rôle crucial dans le maintien de la phosphorylation des protéines en inhibant les phosphatases, qui inversent normalement cette modification. Le remodelage de la chromatine est un autre moyen de réguler l'activité des protéines. La 5-azacytidine et la trichostatine A, en inhibant respectivement les ADN méthyltransférases et les histones désacétylases, facilitent un état plus ouvert de la chromatine, conduisant à l'activation transcriptionnelle des gènes. L'analogue de l'AMPc, le Dibutyryl-cAMP, contourne les récepteurs cellulaires et stimule directement la protéine kinase A, ce qui entraîne la phosphorylation et l'activation de protéines au sein de diverses cascades de signalisation.
La protéostase est maintenue par des composés tels que le MG132, qui inhibe le protéasome, empêchant ainsi la dégradation des protéines et augmentant potentiellement leur concentration cellulaire. De même, le 17-AAG perturbe la fonction de la Hsp90, une chaperonne impliquée dans le repliement et la stabilisation des protéines, ce qui peut entraîner l'activation de ses protéines clientes. Les voies de transduction du signal sont affectées de manière complexe par des molécules telles que le LY294002 et l'U0126, qui sont des inhibiteurs de PI3K et de MEK, respectivement. Ces inhibiteurs peuvent conduire à l'activation de protéines en aval des voies de signalisation. Le SB203580 inhibe spécifiquement la MAPK p38, qui est impliquée dans la réponse aux stimuli du stress et peut affecter l'état d'activation des protéines régulées par cette voie. La signalisation calcique est une autre voie critique affectée par les activateurs chimiques. La thapsigargin perturbe les réserves de calcium en inhibant la pompe SERCA, ce qui entraîne une augmentation du calcium cytosolique susceptible d'activer une série de protéines dépendantes du calcium. La tunicamycine, un inhibiteur de la glycosylation liée à l'azote, joue un rôle dans le repliement et la stabilité des protéines, ce qui peut avoir des effets profonds sur l'état d'activation des protéines.
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