Wortmannin、U0126、SB203580、SP600125などのFAM100Bキナーゼ阻害剤は、細胞シグナル伝達に関与する様々なキナーゼを標的としており、これらのシグナル伝達経路によって制御されている、あるいはこれらのシグナル伝達経路に依存しているタンパク質に間接的に影響を与える可能性がある。トリコスタチンAと5-アザシチジンは、それぞれクロマチン構造とDNAメチル化を修飾することにより遺伝子発現プロファイルを変化させ、FAM100Bを含む広範なタンパク質の発現に影響を及ぼす可能性がある。ボルテゾミブとZ-VAD-FMKは、タンパク質の分解とアポトーシスを調節し、FAM100Bの安定性やターンオーバーに影響を与える可能性がある。
LY294002とラパマイシンは、PI3K/AktおよびmTORシグナル伝達経路を特異的に阻害する。これらのシグナル伝達経路は、成長や代謝を含む様々な細胞機能にとって極めて重要であるため、これらの経路によって制御されるタンパク質に間接的な影響を及ぼす可能性がある。シクロスポリンAとPD173074は、それぞれカルシニューリンと線維芽細胞増殖因子受容体に対する作用においてより特異的であるが、特定のシグナル伝達分子を変化させることで、様々な細胞内タンパク質に下流から影響を及ぼしうることを例証している。
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