C11orf74阻害剤は、このタンパク質がオートファジーに関与していることが知られていることから、この複雑な細胞内プロセスを調節することを主な目的としている。注目すべきは、これらの阻害剤の多くがホスファチジルイノシトール3キナーゼ(PI3K)経路に作用することである。3-メチルアデニン、ワートマンニン、LY294002のような分子は、PI3Kまたはその変異体を直接阻害し、オートファジーにおけるC11orf74の機能的活性を制御する。一方、Bafilomycin A1とChloroquineは、オートファゴソームとリソソームの融合を標的としており、オートファジーの後期段階であるため、C11orf74が機能する全体的な状況を間接的に明らかにしている。
さらに、オートファジーにおけるmTORの中心的な制御的役割を考慮すると、Torin1やラパマイシンのような阻害剤、あるいはMHY1485のような阻害剤は、オートファジーのランドスケープのより広範な調節をもたらし、それがC11orf74の機能にも影響を与える可能性がある。これらの化学物質によってオートファジーのバランスを調整することで、C11orf74の活性を間接的に調節することができるかもしれない。
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