ミトコンドリア膜貫通タンパク質243の化学的活性化物質には、様々なメカニズムでミトコンドリア機能に影響を与える多様な化合物が含まれる。カルシウムイオノフォアA23187は、Ca2+イオンを輸送することにより、細胞内カルシウムレベルに直接影響を与え、ミトコンドリアにおけるカルシウムホメオスタシスプロセスの構成要素として、このタンパク質の活性化につながる。同様に、FCCPはミトコンドリア膜を横切るプロトン勾配を破壊し、勾配を回復してミトコンドリア機能を維持するために、ミトコンドリア膜貫通タンパク質243の活性化を含む反応を必要とする。複合体I阻害剤としてのロテノンと複合体III阻害剤としてのアンチマイシンAの作用は、ミトコンドリアの電子輸送鎖にストレスを与え、その結果、ATP産生を維持するための調節機構の必要性が高まる。このような状況において、ミトコンドリア膜貫通タンパク質243の活性化は、電子輸送が損なわれている中でミトコンドリアの機能維持をサポートする。
さらに、オリゴマイシンによるATP合成酵素の阻害とバリノマイシンによるカリウムイオン勾配の破壊は、いずれもミトコンドリア活性の代償的増加をもたらすが、これにはミトコンドリア膜貫通タンパク質243の活性化が関与している。このタンパク質の役割は、ATPレベルとミトコンドリア膜電位の安定化を助けることである。CCCPも同様に、酸化的リン酸化のカップリングを解除し、ミトコンドリアがプロトン勾配を再確立するように働くため、ミトコンドリア膜貫通蛋白243の活性化につながる。さらに、ジンクピリチオンのような薬剤は、細胞内の亜鉛レベルを上昇させ、ミトコンドリアの亜鉛ホメオスタシスの維持に膜貫通タンパク質243、ミトコンドリアが関与する。ジニトロフェノールはプロトノフォアとして、低下したATP産生効率を補うために代謝量を増加させる必要があり、その結果、ミトコンドリアの膜貫通タンパク質243が活性化される。最後に、ノニルフェノールやパラコートなどの化合物は、それぞれ内分泌機能を破壊し、酸化ストレスを誘導するが、ミトコンドリア機能の完全性を維持するために、ミトコンドリア動態の変化や酸化的課題に反応するため、ミトコンドリア膜貫通タンパク質243の活性化にもつながる。
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